脂肪酸甲酯按照碳链的饱和程度可分为含有双键的不饱和脂肪酸甲酯和不含双键、三键的饱和脂肪酸甲酯。饱和脂肪酸甲酯的主要用途是前述表面活性剂的生产。不饱和脂肪酸甲酯出来可用于前述表面活性剂的生产外，还可以用于生产 环氧脂肪酸甲酯。后者是一种重要的 增塑剂，广泛用于聚等树脂的增塑，可部分代替 邻二甲酸盐类增塑剂。
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脂肪酸甲酯
机体内不仅有软脂酸，还有碳链长短不等的其它脂肪酸，也有各种不饱和脂肪酸，除营养必需脂肪酸依赖食物供应外，其它脂肪酸均可由软脂酸在细胞内加工改造而成。脂肪酸碳链的缩短在线粒体中经β-氧化完成，经过一次β-氧化循环就可以减少两个碳原子。
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不饱和脂肪酸必有1个双键在C⑼和C⑽之间（从羧基碳原子数起）。脂肪酸的双键几乎总是顺式几何构型，脂肪酸甲酯生产厂家，这使不饱和脂肪酸的烃链有约30°的弯曲，干扰它们堆积时有效地填满空间，结果降低了范德华相互反应力，使脂肪酸的熔点随其不饱和度增加而降低。
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